Johann Deisenhofer er en tysk kemiker, som i 1988 sammen med H. Michel og R. Huber modtog nobelprisen i kemi for renfremstilling og strukturbestemmelse af et membranprotein. Johann Deisenhofer er uddannet på det tekniske universitet i München og Max-Planck-Institut i Martinsried, hvor han havde Huber som lærer. Allerede i sine læreår viste han et usædvanligt talent for fremstilling af proteiner i krystallinsk form, røntgenundersøgelser og krystalbeskrivelser. De tre forskeres undersøgelser har givet en dybere forståelse af fotosyntesen.