Den nuværende Holbæk Kommune blev i 2007 dannet af de fem kommuner Holbæk, Tølløse, Jernløse, Svinninge og Tornved. Allerede fra 1990’erne havde de fem kommuner samarbejdet om flere tunge administrative opgaver, og sammenlægningen forløb forholdsvis uproblematisk. Den tidligere Holbæk Kommune var langt den største, og den nye kommune med samlet set ca. 68.000 borgere gik videre med samme navn.
Mod nord og øst afgrænses kommunen af Isefjord, Lammefjord og Holbæk Fjord, og ud til sidstnævnte ligger Holbæk Havn, Hørby Havn og Brønde havn på Orø. I den nordlige del er landskabet præget af store, bløde bakker, mens det mod sydvest danner en slette ned mod Åmose. Mellem Mørkøv og Tølløse findes det særdeles bakkede landskab omkring Grøntved Overdrev og Brorfelde. I området, der kaldes De Sjællandske Alper, finder man bl.a. kommunens højeste punkt, Mørkemose Bjerg på 105,8 m.o.h., samt Observatoriet i Brorfelde, der 1953‑64 blev opført af Københavns Universitet. Observatoriet, hvor man bl.a. finder landets største teleskop, genåbnede i 2016 som et opdagelsescenter.
Stenalderens befolkning (ca. 11.000-ca. 1700 f. Kr.) koncentrerede sig især omkring Åmose og nær områdets søer og vandløb, og der er her gjort mange fund af bl.a. flintredskaber, offergaver, bopladser og grave. I bronzealder og jernalder (ca. 1700-ca. 375 f. Kr.) skete der en udflytning fra indlandet til fjordenes brede vandstrøg, og flere af de landsbyer, man med sikkerhed kender fra middelalderen, som Svinninge, Gislinge og Tuse, antages at være anlagt allerede der. I de kystnære egne foregik størstedelen af transporten via vandvejen, hvilket bl.a. ses af Gislingebåden fra ca. 1150, fundet i den nu inddæmmede del af Lammefjord. Indlandets skovrige egne var derimod svært fremkommelige, men med den øgede bosætning blev disse delvis ryddet, hvilket lettede tilgængeligheden og med tiden gav bedre plads til agerbruget. De vidtstrakte marker, der præger store dele af kommunen, vidner om de mange herregårdsanlæg, som repræsenterer byggerier fra middelalderen til 1900-tallet.
Ud for mundingen af Holbæk Fjord ligger Orø, hvor talrige fund vidner om, at øen har været beboet siden stenalderen. Med en meget høj opdyrkningsgrad er øens naturområder nu hovedsagelig begrænset til kysten, hvor der findes et rigt fugleliv og et bemærkelsesværdigt planteliv med sjældenheder som bl.a. mygblomst, sumphullæbe og kødfarvet gøgeurt. Orø, der i dag er en populær turistdestination, har to færgesteder – et på den vestlige side af øen, hvortil man sejler fra Holbæk, og et på østsiden, hvortil man sejler fra Hammer Bakker i Hornsherred. Især denne rute er årsag til, at Orø kan fastholde et højt befolkningstal, da den med en overfartstid på blot seks minutter er hurtig for pendlere.
Jernbanen fra København til Kalundborg blev i 1874 ført gennem kommunen. Det fik en række småbyer til at blomstre op som stationsbyer, og blandt andre de byer, der i dag er kommunens tre største, Holbæk, Jyderup og Tølløse, oplevede et voldsomt opsving. Kommunens hovedby, Holbæk, der nævnes første gang i 1199, blev købstad i anden halvdel af 1200-tallet. Placeringen ved fjorden var gavnlig for byens og områdets udvikling, og i middelalderen skete der en betydelig befolkningstilvækst, og dominikanerordenen opførte kloster og klosterkirke. Byen oplevede økonomisk fremgang bl.a. som følge af kornhandel, og med den senere industrialisering formede især jernstøberier og maskinfabrikker byens profil.
På Isefjordsvej i Holbæk ligger den tidligere Bygmesterskolen, der nu er omdannet til ejerlejligheder. Den blev grundlagt i 1915 som en del af bevægelsen Bedre Byggeskik, og her efteruddannedes håndværkere i stilhistorie og klassiske teknikker. Skolen lukkede i 1978, men dens arv kan ses overalt i landet, og i Holbæk er et helt kvarter planlagt og bygget efter Bedre Byggeskiks principper. Holbæk er en betragtelig uddannelsesby med to gymnasier, sygeplejeuddannelse, sosu-uddannelse og EUC. I kommunens næststørste by, Jyderup, finder man den grundtvigianske Jyderup Højskole i det tidligere lystslot Sølyst.
Bortset fra landbrug og skovbrug har erhvervslivet haft en tendens til at koncentrere sig i Holbæk. Den offentlige sektor tegner sig for en forholdsvis stor andel af beskæftigelsen, hvilket bl.a. skyldes, at der er en del statslige og regionale arbejdspladser, heriblandt Holbæk Sygehus og Jyderup Fængsel. I kommunens fjerdestørste by, Svinninge, med lige under 3.000 indbyggere, findes et af landets største energiselskaber, Andel A.m.b.a., der har ca. 400.000 kunder som andelshavere. Andel er kommunens største private arbejdsplads med 500 ansatte i Svinninge. Den nye Holbæk Sportsby er et forsøg på at samle byens idrætsforeninger under ét tag og udnytte de synergier, der kan opstå heraf.
Kulturlivet er bredt. I Holbæks sydlige udkant ligger Oplevelsescenter Nyvang med kirke, traktørsted og brugsforening. Her formidles hverdagen, som den oplevedes i midten af 1900-tallet. Holbæk er en teaterstærk kommune; Sjællands Teater opstod i 2021 som en fusion af Holbæk Teater og Teatret Fair Play, der begge har egne forestillinger og gæstespil, og siden 2014 har de to teatre i samarbejde udbudt et treårigt grundkursus for unge teatertalenter. Musikhus Elværket, der drives af Holbæk Kulturskole, afholder med hjælp fra et stort netværk af frivillige 50‑60 koncerter årligt. Og med en lang tradition for gavlmalerier er både Holbæks bymidte og 1970’ernes mere perifere montagebyggerier præget af visuelle værker i storformat.